人類學系標本陳列室的收藏與建置，肇始於1928年臺北帝國大學「土俗人種學講座」時期。系藏標本以1920至1960初期入藏的臺灣原住民各種生活器具，以及自始迄今不斷在臺灣考古遺址調查發掘出土的史前遺物為主。
民族學藏品共有五千多件，最早可追溯至1895年由在臺灣進行原住民研究的先驅伊能嘉矩所採集之珍貴藏品，如泰雅族貝珠衣、馘首標幟，及平埔族雕刻和衣飾等。到了1928年臺北帝大「土俗人種學講座」成立標本室，移川子之藏和宮本延人等為推展民族學研究，才開始系統性累積各族服飾、木雕、陶器、和生業用具等物質文化標本。
考古學標本因田野發掘工作的持續，出土藏品仍在累積中，現已達數十萬件之多；其中第一批入藏標本為舊臺北市圓山動物園西側的圓山貝塚遺址，該次學術工作，是臺灣考古學的第一次正式發掘。此後本系師生持續在臺灣各地遺址進行大規模的發掘與出土物的收藏，其中如舊石器時代的長濱文化，新石器時代的墾丁、圓山、大坌坑、大馬璘、卑南文化，及至鐵器時代的十三行文化等，都呈現出臺灣史前各時期的特色風貌。
目前的展示分為兩大單元，一樓的民族學展廳以「臺灣原住民物質文化」為主題，依族群分別陳列器物和相關圖文說明，用以展現各族群物質文化特色；此外，亦包括『臺灣原住民陶器』和『太平洋群島的植物利用』等專題展示。二樓考古學展廳以「臺灣史前文化」為主題，主要利用出土器物解說臺灣史前文化的特色，另亦有『麒麟文化的巨石結構』、『臺灣史前文化墓葬類型』、及『民族考古學與實驗考古學研究成果展』等專題展示。
本系標本陳列室注重第一手田野材料，係一具有特殊價值的小型專業人類學博物館，在臺灣考古與人類學的發展歷程中，有其一定的貢獻。
＊現因館舍搬遷，自97年6月15日起閉館，新址開館日期另行通知。
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